數(shù)據，但是，如何有效解讀這些數(shù)據仍是目前研究工作中亟待解決的一個問題。
所以說，在新藥的開發(fā)過程中，目前最大的問題不僅僅是如何設計科學合理的臨床試驗，解釋藥品反應，還要合理分析、運用試驗過程當中產生的數(shù)據，以便對藥物產生的臨床反應作出更好的解釋。
生物標記法生輝
目前，大批分子標記方法及技術在新藥品的研發(fā)領域已經得到了廣泛應用。尤其是微陣列技術，高通量Taqman探針(Hight-throught put Taqman)，b-DNA探針法(Branched DNA)以及各類蛋白質組學技術。其中應用生物標記法，可以追綜靶點物質在體內的生化過程，包括其致病機理，從而使藥物的臨床治療成為可能。
概括來說，生物標記法的研發(fā)過程主要包括3個部分。首先，利用分子標記技術了解藥品分子對靶點物質的相關生化活動及其作用機制(target pathway)產生的影響(即新藥品如何影響靶點分子的生化活動)，從而找到藥品的暴露量與臨床反應之間的聯(lián)系(exposure-response)。其次，逐步確定臨床服用藥量，雖然利用生物標記方法不能直接明確藥的服用量，但是可以通過逐步縮小其用量的范圍，最終確定出一個合理的臨床用量。最后階段是病人的分層。
此外，單核苷酸多態(tài)性(SNPs)以及拷貝數(shù)變異(CNVs)被認為是新一代的分子標記，并用于藥物遺傳學研究。單核苷酸多態(tài)性(SNPs)適合于某些疾病的遺傳解剖，因其能識別與疾病相關的基因，且易于對該基因分型。
事實上，目前常用的諸多方法很大程度上已經能足夠用于單核苷酸多態(tài)性(SNPs)研究，但研究人員仍舊不斷對某些方法進行改進和完善，以期在基因測序的過程當中發(fā)現(xiàn)某些微小的突變，例如某DNA片段的增加或缺失，從而發(fā)現(xiàn)這些遺傳信息的微小突變是否能引起病人對藥品的其它反應，即某些不良反應。
然而，如果在科學家已經足夠了解藥物靶點的生化過程，以及藥物有相當不錯的治療效果的情況下，就不再重視這些技術平臺的使用，這樣的做法顯然不夠明智，因為與發(fā)展成熟的藥物相關的診斷相比還需得到更多的重視。
高通量篩選助力
高通量技術(HTS)又稱組合自動控制、機器人操作或其他自動化新技術，是一種通過一系列的測試對化合物進行快速分析的方法。在治療方面，這些測試通常包括化合物與疾病對象的相互作用過程。研究人員發(fā)現(xiàn)，運用HTS強大的引擎，可以用于發(fā)現(xiàn)許多有潛力的新化合物。該技術的最大優(yōu)點在于使每項分析都小型化，這樣就能篩選大量的標本，是一種能夠降低成本有效方式，而其他方法每次只能篩選一個目標，成本很高。
據報道，最近一些公司還用新的方式對現(xiàn)有HTS的技術進行組合改造。例如，Applied Biosystems公司和MDS Sciex合資生產的FlashQuant工作臺，在一臺三級四極桿質譜分析儀上采用MALDI和多級反應監(jiān)測模式，以獲得高通量的小分子定量能力，尤其在小分子在小分子定量方面，與當前分析速度最快的液相—三級四極桿質譜儀相比，新產品的速度提高了25倍。
這種系統(tǒng)可以像微陣列或平板讀取器一樣進行樣品進樣，一次可以進行多重點樣，而以前是無法做到這一點的。該技術據稱進行化合物篩選時能提供無與倫比的分析速度，同時該儀器也將顯著提高藥物研發(fā)早期階段的通量效率，降低先導化合物的失敗率。
除了利用HTS獲得更多更好的化合物外，研究人員還利用HTS去獲得更好的靶標。如默沙東公司不久前用全基因組siRNA篩選去鑒定新的靶標，進而發(fā)現(xiàn)了新的目標通道。