請、預算編制、經費執(zhí)行調整和考評的風險控制，促進預算風險、績效和激勵監(jiān)督相互促進的有效機制。各科研項目承擔單位應當分析預算執(zhí)行率所產生原因和存在問題的基礎上，制定適合本單位科研項目結余資金的具體管理辦法，切實盡所能的提高經費預算執(zhí)行率。
3.2 促進科研項目預算管理精細化
提升預算編制的準確性，從源頭上控制好科研項目經費的精細化編制。申報科研項目要進行充分的可1和溝通，項目負責人最好能召集科技管理部門、國有資產管理和財務人員進行研討整理，提升預算編制的合理性，將預算細化到具體支出科目，切實將申請的經費能夠合情合理合法的使用。
在科研項目經費具體研究過程中，項目負責人依據(jù)科研項目進行的情況，詳細制定經費使用規(guī)劃，并將下一步的工作方案及時通知財務人員和科技管理部門。財務人員和國有資產管理部門能夠及時掌握科研項目的進展情況，及時的實施采購計劃，進行招投標等工作，在完成設備購置和合同簽訂的同時，保障了科研項目工作的順利進行，同時財務也能都隨時統(tǒng)計和掌握應付款和未付款的項目經費，并告知項目負責人抓緊時間與相關單位溝通及時結算，精確的反應科研項目的開支情況，提高經費的執(zhí)行率。
3.3 建立科研項目經費執(zhí)行率獎勵機制
科研項目管理單位應當建立經費執(zhí)行率獎勵制度，提升實驗室和大型儀器設備的使用率，優(yōu)化科技資源配置，提高科研經費的使用效益。因為節(jié)約和提升經費使用效率，執(zhí)行率比較好的科研項目應當給予配套獎勵，科研主管單位對科研項目的獎懲措施比較寬松，不能僅僅表揚先進，將獎勵落實到實處，而將懲罰措施放置在紙面上。對于那些當年執(zhí)行進度緩慢、預計年底可能形成較多結轉或結余資金的項目，財政部門審批后及時調減，對于常年累計結余資金規(guī)模較大，應當給予壓縮其當年預算，有結題不結賬的科研項目應當及時收回其科研經費。只有獎勵和懲罰相結合，才能帶來雙重的效果。同時財務和科技管理部門還要嚴格遵守國家相關法律法規(guī)和會計制度，嚴禁借助提高預算執(zhí)行率名義，弄虛作假，虛列支出，擠占挪用項目資金。
3.4 加強外部交流
加強單位之間業(yè)務部門信息溝通，及時了解科研項目橫向合作的進展情況，快速反應協(xié)調解決項目進展中存在的問題，積極推進項目進展。對于進度拖延的項目，要注重謀劃、精心組織，精細的考慮計算后續(xù)工作中存在著困難，執(zhí)行詳細工作計劃。特別是對那些協(xié)作項目有些滯后的課題，要有重點，有目標的進行跟蹤、督查，多花些力氣和時間進行推進，促進其加快速度，合理提升科研項目預算執(zhí)行率。
在對科研項目預算執(zhí)行率出現(xiàn)諸多問題的總結，探討出預算經費執(zhí)行率不高的制約因素，并提出了一些解決方案。通過財務管理政策的制定和實施，主管單位對科研項目經費的積極管理，項目組、科技管理部門和財務部門能夠協(xié)調統(tǒng)一融合，暢通項目執(zhí)行信息。
加強科研項目預算執(zhí)行率過程的監(jiān)督和控制，減少了科研項目經費為提升執(zhí)行率而出現(xiàn)“突擊花錢”現(xiàn)象的同時，使得科研經費能夠合情、合理、合法得使用，提高科研項目資金的使用效率和效益。不但能夠嚴格控制經費的支出嚴格按照預算批復的進行，還能夠提前對下一步的預算進行調整和變更提供預設方案，確保在變更的同時，預算經費執(zhí)行率的提升。