費用預算有兩種基本方法：自上而下方法和自下而上方法 。采用哪一種方法，主要與項目組織的決策系統有關。
（1）自上而下的項目預算
這種方法主要依賴于中上層項目管理人員的經驗和直覺（判斷）。這些經驗和判斷可能來自于歷史數據或相關項目的現實數據。首先，由項目的上層和中層管理人員對項目的總體費用、構成項目的子項目費用進行估計，這些估計的結果給予低層的管理人員，在此基礎上他們對組成項目或子項目的任務和子任務的費用進行估計。然后向下一級傳遞，直到最底層。
這種預算方法的是，當上層的管理人員根據他們的經驗進行的費用估計分解到下層時，可能會出現下層人員認為上層的估計不足以完成相應任務的情況。這時，下層人員不一定會表達出自己的真實觀點，不一定會和上層管理人員進行理智地討論，從而得出更為合理的預算分配方案。在實際中，他們往往只能沉默地等待上層管理者自行發(fā)現問題并予以糾正，這樣往往會給項目帶來諸多問題，有時甚至導致項目失敗。
人們通常認為，項目預算的過程是一個零和博弈，一方的獲得意味著另一方的損失。其間充斥著權利的爭奪和激烈的競爭。
自上而下方法的優(yōu)點主要是總體預算往往比較準確。其次，由于在預算過程中，總是將既定的預算在一系列工作任務間分配，避免了某些任務獲得了過多的預算而某些重要任務又被忽視的情況。
（2）自下而上的項目預算
自下而上方法要求運用WBS對項目的所有工作任務的時間和預算進行仔細考察。最初，預算是針對資源（團隊成員的工作時間和原材料）進行的，然后才轉化為所需要的經費。所有工作任務估算的總體匯總就形成了項目總體費用的直接估計。項目經理在此之上再加上適當的間接費用（如管理費用、不可預見費等）以及項目要達到的利潤目標就形成了項目的總預算。
自下而上的預算方法要求全面考慮所有涉及到的工作任務。和自上而下預算方法一樣，自下而上預算方法也要求項目有一個詳盡的WBS。自下而上預算方法也涉及到一定的博弈形勢。例如，當基層估算人員認為上層管理人員會以一定比例削減預算時，他們就會過高估計自己的資源需求。這樣又會使得高層管理人員認為下層的估算含有水分，需要加以削減，從而陷入一個怪圈。
自下而上預算的優(yōu)點是，基層人員更為清楚具體活動所需的資源量。而且由于預算出自于基層人員之手，可以避免引起引起爭執(zhí)和不滿。
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